区分纯合子与杂合子的原则是纯合子能稳定遗传，自交后代不发生性状分离；杂合子不能稳定遗传，自交后代往往会发生性状分离。实验鉴别的方法有三种：
(1)测交法(常用于动物的鉴别)
待测个体×隐性纯合子
↓
结果分析
(2)自交法(常用于植物的鉴别)
待测个体
↓
(3)花粉鉴别法
杂合子的某些性状可以从花粉的比例直接鉴定，如非糯性与糯性水稻的花粉遇碘呈现不同的颜色。
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